2005年4月，连战率团访问大陆，并与胡锦涛总书记举行会谈，双方达成五项共同愿景。举办两岸经贸论坛是其中一项重要内容。论坛原计划于2005年12月下旬在台北举办。由于台湾当局不予批准，大陆代表团未能如期赴台，以致论坛至今未能在台北举办。

　　2006年3月15日，中国国民党方面表示基于提振台湾经济，繁荣人民生活，缓和两岸关系，建议将首届两岸经贸论坛移至大陆举办。经双方商谈后决定，2006年4月14日至15日在北京举办两岸经贸论坛。

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